不可以翻建因为城镇房屋所有权人户口不在，虽然可以通过租赁和转让的方式获得该房屋的所有权，但在建筑翻修方面，必须要遵守规定，严格按照当地的翻建规定进行操作，否则将会涉及到违法问题。
此外，即使符合规定进行翻建，还需考虑周围邻居的权益，必须要在公示期内公示，该业主的翻建计划是否有其他邻居的反对意见等，否则也有可能被驳回。
城镇居民占用农村土地建房，办证不通过，但却在村委会登记办理了房屋证，这种情况并不合法。
首先，农村土地是属于集体所有，不能被个人或单位私自占用或建房。其次，如果办证不通过，则说明违反了法律和规定，没有取得建房的合法权利，村委会办理的房屋证并不合法。
在这种情况下，如果涉及到城镇居民非法占用农村土地建房，相关部门有权依法采取措施进行制止，对于已经建成的房屋，可以要求拆除或者按照与村民协商一致的方式进行相应的土地租赁或购买手续，并按照相应规定支付相应的费用。
不可以翻建，因为城镇房屋所有权人户口不在并不是城镇翻建规定中的允许条件之一。
根据《城市房屋拆迁与补偿条例》和《城市房屋建设和管理条例》等法规规定，只有在取得相关部门的批准和满足相应条件的情况下，方可进行房屋翻建。
如未满足条件或未获得批准，则属于违法行为。
同时，城镇房屋翻建还需考虑到土地、环保等多方面因素，规定较为复杂，需要综合考虑各方面情况后才能决策。
另外，对于城镇房屋所有权人户口不在的情况，可以结合相关法规及政策，通过法律途径或委托代理人代为办理相关手续和程序，以达到合法翻建的目的。