单位在为员工缴纳社保时，可能会因为员工离职、调动等原因，没有及时更改员工社保信息，导致社保差额漏缴。

社保政策可能随时发生变化，如果单位没有及时跟进政策变化，也可能出现社保差额漏缴的情况。

个别员工可能对社保缴纳的重要性意识不够，没有积极配合单位办理社保补缴手续，也可能导致社保差额漏缴。