玻璃奶瓶最常用的消毒方法是开水煮沸消毒，也可以使用蒸汽消毒。
在进行开水煮沸消毒时，首先需要在流动的清水下，使用干净的刷子将奶瓶从里到外刷洗干净；然后取出奶嘴及其他橡胶制品，将奶瓶放入开水中，煮沸消毒5～8分钟左右，然后再将奶嘴及其他橡胶制品放入开水中，再煮沸消毒3～5分钟左右。最后擦干使用。
蒸汽消毒是使用专门的蒸汽消毒锅或奶瓶消毒器，进行奶瓶的消毒，操作期间比较方便。在进行蒸汽消毒前，也需要将奶瓶清洗干净，然后将奶瓶中的奶嘴拆下来，将瓶身倒立放入消毒器皿，奶嘴放在特定的位置，最后盖上盖子，插上电源即可。
正确的新生儿玻璃奶瓶消毒方法包括以下步骤：首先将婴儿奶瓶及其附件用清洁的刷子清洗干净，随后将瓶子浸泡在高锰酸钾或其他专业消毒液中约15分钟，再用清水彻底冲洗干净即可。在消毒过程中需要注意手部卫生，禁止使用已过期或没有进行使用说明的产品，以保证消毒效果和宝宝的安全。此外，换新瓶嘴或奶瓶时要特别注意消毒，以避免交叉感染或患病。